São Paulo Research Foundation

Underway

2024 - Current: Communicating science: Normalization of H&E stain by autoencoders with analysis of ensemble learning for histological images (Comunicar Ciência: Normalização de corantes H&E por autocodificadores com análises de ensemble learning para imagens histológicas)

Integrants: Thaína Aparecida Azevedo Tosta - Coordinator, João Paulo Paixão Rocha - Supervised, Leon Nilson Gomes de Lima - Supervised.

Executing Institution: Federal University of São Paulo.

Financial support: São Paulo Research Foundation (FAPESP) - Scientific journalism.

2024 - Current: Computational systems for analysis of public H&E histopathological images: a systematic review (Sistemas computacionais para análises de imagens histopatológicas H&E públicas: uma revisão sistemática)

Integrants: Thaína Aparecida Azevedo Tosta - Advisor, Anna Clara Medina Roissmann - Supervised.

Executing Institution: Federal University of São Paulo.

Financial support: São Paulo Research Foundation (FAPESP).

2023 - Current: Computational method of spectral matching for color normalization of H&E images by autoencoders (Método computacional de correspondência espectral para normalização de cores de imagens histológicas H&E por autocodificadores)

Integrants: Thaína Aparecida Azevedo Tosta - Advisor, Hanna Beatriz Couto Monteiro Fernandes de Castro - Supervised.

Executing Institution: Federal University of São Paulo.

Financial support: São Paulo Research Foundation (FAPESP).

2023 - Current: Normalization of H&E stain by autoencoders with analysis of ensemble learning for histological images (Normalização de corantes H&E por autocodificadores com análises de ensemble learning para imagens histológicas)

Integrants: Thaína Aparecida Azevedo Tosta - Coordinator, Leandro Alves Neves - Integrant, Marcelo Zanchetta do Nascimento - Integrant, Paulo Rogério de Faria - Integrant.

Executing Institution: Federal University of São Paulo.

Financial support: São Paulo Research Foundation (FAPESP).

National Council for Scientific and Technological Development

Underway

2024 - Current: Classification of H&E histological images of colorectal lesions by support vector machines (Classificação de imagens histológicas H&E de lesões colorretais por máquinas de vetores de suporte)

Integrants: Thaína Aparecida Azevedo Tosta - Advisor, Ludmila Pinhal Martinez - Supervised.

Executing Institution: Federal University of São Paulo.

Financial support: National Council for Scientific and Technological Development (CNPq).

Concluded

2018 - 2022: Multiresolution-Based Methods for Lesion Detection in Images of the Oral Cavity (Métodos Baseados em Multiresolução para Detecção de Lesões em Imagens da Cavidade Bucal)

Integrants: Thaína Aparecida Azevedo Tosta - Integrant, Leandro Alves Neves - Integrant, Marcelo Zanchetta do Nascimento - Coordinator, Paulo Rogério de Faria - Integrant, Alessandro Santana Martins - Integrant, Guilherme Freire Roberto - Integrant.

Executing Institution: Federal University of Uberlândia.

Financial support: National Council for Scientific and Technological Development (CNPq).

 Minas Gerais State Research Foundation

Concluded

2018 - 2024: Identification of Histological Modifications in the Oral Cavity using the Multiscale Curvelet Technique and Fractal Geometry (Identificação de Alterações Histológicas de Cavidade Bucal por Meio de Técnica Multiscala Curvelet e Geometria Fractal)

Integrants: Thaína Aparecida Azevedo Tosta - Integrant, Leandro Alves Neves - Integrant, Marcelo Zanchetta do Nascimento - Coordinator, Paulo Rogério de Faria - Integrant, Adriano Mota Loyola - Integrant, Bruno Augusto Nassif Travençolo - Integrant, Alessandro Santana Martins - Integrant, Adriano Barbosa Silva - Integrant, Dali Freire Dias dos Santos - Integrant, Guilherme Freire Roberto - Integrant.

Executing Institution: Federal University of Uberlândia.

Financial support: Minas Gerais State Research Foundation (FAPEMIG).

Other Research Foundations

Underway

2024 - Current: Classification of colorectal lesions by pyramid representations and morphological features (Classificação de lesões colorretais por representações de pirâmide e atributos morfológicos)

Integrants: Thaína Aparecida Azevedo Tosta - Advisor, Jonatas Carrocine - Supervised.

Executing Institution: Federal University of São Paulo.

Financial support: -

2022 - Current: Algorithm for color normalization of hematoxylin-eosin stain of histological images by deep learning networks (Algoritmo para normalização de cores de corantes de hematoxilina-eosina de imagens histológicas por redes de aprendizagem profunda)

Integrants: Marcelo Zanchetta do Nascimento - Advisor, Thaína Aparecida Azevedo Tosta - Joint advisor, André Dias Freitas - Supervised.

Executing Institution: Federal University of São Paulo.

Financial support: -

Concluded

2023 - 2024: Color normalization of histological images stained with H&E using dictionary learning (Normalização de cores de imagens histológicas coradas com H&E usando aprendizagem de dicionário)

Integrants: Thaína Aparecida Azevedo Tosta - Advisor, André Fernando Quaresma da Silva - Supervised.

Executing Institution: Federal University of São Paulo.

Financial support: -

2021 - 2022: Analysis of neural networks trained with evolutionary algorithms for the classification of breast cancer histological images (Análise do uso de redes neurais com algoritmos evolutivos para a classificação de imagens histológicas de câncer de mama)

Integrants: Thaína Aparecida Azevedo Tosta - Advisor, João Pedro Miranda Miguel - Supervised.

Executing Institution: Federal University of São Paulo.

Financial support: -

2022 - 2023: Feature selection techniques of magnetic resonance imaging for classification of cerebral tumors: a review (Técnicas de seleção de características para classificação de tumores cerebrais: uma revisão)

Integrants: Thaína Aparecida Azevedo Tosta - Advisor, Keziah Emerick - Supervised.

Executing Institution: Federal University of São Paulo.

Financial support: -

2022 - 2024: H&E-stain normalization of histological images using generative adversarial networks: a brief review (Normalização de corantes H&E em imagens histológicas usando redes generativas adversárias: uma breve revisão)

Integrants: Thaína Aparecida Azevedo Tosta - Advisor, Laís Pereira da Silva - Supervised.

Executing Institution: Federal University of São Paulo.

Financial support: -

2023 - 2024: Segmentation by deep learning of brain tumors in magnetic resonance imaging: a review (Segmentação por aprendizado profundo de tumores cerebrais em images de ressonancia magnética: uma revisão)

Integrants: Thaína Aparecida Azevedo Tosta - Advisor, Lavínia Ferreira Novais - Supervised.

Executing Institution: Federal University of São Paulo.

Financial support: -

2022 - 2023: Recycling knowledge: analysis of transfer learning for classification of white blood cells in hematology images (Reciclando conhecimentos: análise de transferência de aprendizado para classificação de glóbulos brancos em imagens hematológicas)

Integrants: Thaína Aparecida Azevedo Tosta - Advisor, Rafael Moreira Corrêa - Supervised.

Executing Institution: Federal University of São Paulo.

Financial support: -